Музыку к «Ледниковому периоду 3» написал Джон Пауэлл — автор саундтрека к предыдущей части; все его композиции в этом мультфильме являются новыми, с использованием основных музыкальных тем из «Глобального потепления». Куин Латифа (озвучивающая Элли) исполнила в мультфильме песню «Walk the Dinosaur» группы Was (Not Was), которая, однако, не вошла в официальный саундтрек.
1. «Code Blue» (01:44) 2. «Pregnant» (01:56) 3. «Leaving the Herd» (01:50) 4. «The Cavern» (00:33) 5. «Magic Eggs» (00:13) 6. «Egg Roll» (02:08) 7. «The Cliff» (00:19) 8. «Sid’s Kids» (01:36) 9. «Nest» (01:22) 10. «Playground» (01:34) 11. «Scrat Finds Furry Love» (00:41) 12. «Momma» (03:38) 13. «Entry to Lost World» (01:36) 14. «Dinosaur Vista» (00:34) 15. «Meet Buck» (02:59) 16. «Flower of Death» (02:49) 17. «Nose Job» (01:35) 18. «Trek» (01:00) 19. «Chasm of Death» (00:22) 20. «Big Smelly Crack» (03:10) 21. «We Shall Raise Them Vegetarian» (02:20) 22. «Campfire Stories» (01:19) 23. «Flashback» (00:59) 24. «Nite Nite» (00:45) 25. «You’ll Never Tango» (00:48) 26. «Herd Crossing» (00:37) 27. «Plates of Woe» (03:58) 28. «Battle Cry» (00:16) 29. «Buck’s Theme» (00:38) 30. «Battles» (04:05) 31. «Over the Falls» (00:13) 32. «Rescues» (03:33) 33. «Alone Again» (01:54) 34. «To the Portal» (00:54) 35. «Rudy Fight» (02:12) 36. «Farewell» (01:42) 37. «Out of This World» (00:33) 38. «Buck Returns» (01:08) 39. «Welcome to the Ice Age» (01:58) 40. «At Home with the Scrats» (00:26) 41. «The Call of the Siren Acorn» (00:16) 42. «True Love for Our Hero» (00:23) 43. «End Credits» (07:00) 44. «You’ll Never Find Another Love Like Mine» (04:26) Трек 33 «Alone Again», исполняемый Чедом Фишером — кавер-версия одноимённой песни Гилберта О'Салливана с переписанным в сторону романтики и юмора текстом. Трек 44 «You’ll Never Find Another Love Like Mine» — песня Лу Роулса, используемая в мультфильме для сцен со Скрэтом и Скрэтти. Также на музыкальной теме этой песни основаны треки 11, 25 и 40, написанные Кенеттом Гэмблом и Леоном Хаффом.
В треках 41 и 42 используется музыка из балета «Спартак» Арама Хачатуряна.